Το αεροπορικό ταξίδι μπορεί να προκαλέσει θρόμβωση σε βαθιές φλέβες και, μετά σαν επακόλουθο, πνευμονική εμβολή. Το γεγονός αυτό προκαλεί ανησυχίες στο κοινό, όπως και στην ιατρική και επιστημονική κοινότητα.

Το ότι η παρατεταμένη καθιστική θέση μπορεί να προκαλέσει θρόμβωση φλεβών είναι γνωστό εδώ και μερικές δεκαετίες. Το 1954 και 1977 περιγράφηκαν σε επιστημονικά περιοδικά περιστατικά θρομβοεμβολικής νόσου μετά από μακράς διάρκειας αεροπορικό ταξίδι. 

Επίσης κατά τη διάρκεια του δεύτερου παγκοσμίου πολέμου σε Βρετανούς που έμεναν καθιστοί για πολλές ώρες σε αντιαεροπορικά καταφύγια είχε βρεθεί ότι είχαν 6 φορές αύξηση πιθανότητας ξαφνικού θανάτου λόγω φλεβικής θρόμβωσης και πνευμονικής εμβολής. 

Κάθε χρόνο αναφέρονται αρκετές περιπτώσεις επιβατών, που ξαφνικά μετά την αποβίβασή τους, παθαίνουν πνευμονική εμβολή μετά από αεροπορικές πτήσεις.

Παρ' όλα αυτά οι επιστήμονες δεν έχουν ακόμη πεισθεί πλήρως ότι υπάρχει πράγματι αιτιολογική σχέση μεταξύ της θρόμβωσης και του ταξιδιού. 

Οι μηχανισμοί που έχουν ενοχοποιηθεί μέχρι σήμερα για τη γένεση του φαινομένου αυτού είναι η φλεβική στάση λόγω παρατεταμένης καθιστικής στάσης, η πίεση που εξασκείται στη μεγάλη φλέβα πίσω από το γόνατο, η αιμοσυγκέντρωση που δημιουργείται λόγω μειωμένης πρόσληψης και αυξημένης απώλειας υγρών, οι ανωμαλίες του συστήματος πήξης αίματος που δημιουργούνται σε υποβαρικό και υποξικό περιβάλλον.

Σίγουρα χρειάζονται ακόμη μελέτες και δεδομένα για το πρόβλημα αυτό. Όμως κάποια προληπτικά μέτρα μπορούν να εφαρμοστούν από τώρα:

1. Οι επιβάτες στα αεροπλάνα να σηκώνονται από τα καθίσματα κατά διαστήματα, να πίνουν άφθονο νερό και να κάνουν ασκήσεις τεντώματος των ποδιών
   
   
2. Τα άτομα που έχουν ιστορικό ψηλού κινδύνου, όπως θρόμβωση φλεβών, ορμονικής θεραπείας, πρόσφατης  χειρουργικής επέμβασης ή πάσχουν από κακοήθη νόσο πρέπει να συζητήσουν με τους θεράποντες ιατρούς τους την αναγκαιότητα λήψης προστατευτικών μέτρων.